او مدرک کارشناسی خود را در رشتهٔ مهندسی عمران از دانشگاه فردوسی مشهد و کارشناسی ارشد در رشتهٔ مدیریت دولتی را از مرکز آموزشی مدیریت دولتی دریافت کرده‌است.

سید محمد پژمان از اردیبهشت ۱۳۸۶ تا شهریور ۱۳۹۲ شهردار مشهد بود. او پیش‌تر در سمت‌های مدیر کل مسکن و شهرسازی استان خراسان، شهردار منطقه ثامن و معاونت فنی و عمران استانداری خراسان رضوی فعالیت داشته‌است.

او در دوران شهرداریش، رئیس هیأت مدیرهٔ شرکت قطار شهری مشهد و شرکت نمایشگاه بین‌المللی مشهد نیز بود.

سید محمد پژمان، شهردار سابق مشهد مهر سال 1392 به عنوان معاون وزیر راه و مديرعامل سازمان ملي زمين و مسکن انتخاب شد.